Magnesium oksida adalah agen rawatan air sisa yang cekap yang berkesan dapat menghilangkan ion logam berat seperti plumbum, kadmium, merkuri, dan lain -lain dari air kumbahan. Ia membentuk precipitates yang tidak larut melalui tindak balas kimia, dengan itu mengeluarkan bahan berbahaya dari air. Di samping itu, ia boleh menyesuaikan keasidan dan kealkalian air sisa, meneutralkan air kumbahan berasid, dan mencapai julat pH yang sesuai untuk rawatan berikutnya. Magnesium oksida juga boleh berfungsi sebagai flocculant untuk membeku dan mendakan zarah yang digantung di air kumbahan, memurnikan badan air
